根据相关法规，每一种转基因食品上市前至少要经过三个部门的审查，农业部负责管理转基因植物的开发和田间试验；环保署负责评估转基因植物的环境影响，负责管理涉及转基因技术的杀虫剂等药物监控，负责公众安全和环境保护；药管局则负责转基因食品和饲料的安全性评估，其中包括任何被定义为转基因的食物，也包括对所有来自植物的食物和动物饲料的安全与分类的职责。转基因食品上市前必须符合传统的食品卫生标准，任何一个转基因食品上市都需要好几年时间，花1000万至1500万美元(1美元约合6.16元人民币)才能搜集完成审批所需要的数据。
比如最近被中国农业部批准的三种转基因大豆品种之一CV127大豆，据美国农业部在2012年相关征求公众意见的问与答中表示，CV127大豆的田间实验在巴西完成。美国食品和药物管理局在2012年1月在其官网上公布安全性评估报告。报告显示，2009年1月，巴斯夫公司向该机构提交安全性与营养的评估申请，此后又于当年5月和2011年5月提交了补充信息。药管局对这些信息进行了评估，以解决其进入商业流通前与食品或饲料相关的管理和安全问题。评估过程中，除了巴斯夫提供的信息外，药管局也考虑了已公开的信息和该机构相关资料信息。审批历时两年，最终通过。
